Общелабораторный семинар ЛИТ им. М.Г. Мещерякова

Europe/Moscow
Description

Вторник, 18 мая 2021 г. в 15.00
Конференц-зал ЛИТ
Онлайн семинар Webex

Бутенко Юрий Александрович

Разработка информационных систем для теоретических и прикладных задач на базе платформы HybriLIT

В докладе представлен обзор двух разрабатываемых информационных систем (ИС) на базе платформы HybriLIT. Основной целью создания этих ИС является автоматизация проведения расчетов, а также обеспечение хранения и анализа данных для различных групп исследователей.
       Информационная система, предназначенная для проведения радиобиологических исследований, предоставляет инструментарий для хранения экспериментальных данных различных типов, набор программных средств для анализа поведенческих паттернов лабораторных животных и для изучения патоморфологических изменений в центральной нервной системе после воздействия ионизирующего излучения и других факторов. Данная ИС включает в себя блоки по хранению и предоставлению доступа к экспериментальным данным и блок анализа данных на базе алгоритмов машинного и глубокого обучения и алгоритмов компьютерного зрения.
      Также на базе платформы HybriLIT ведется разработка виртуальной исследовательской среды (ВИС) для моделирования физических процессов в сложных системах, основанных на джозефсоновских переходах. ВИС сочетает в себе удобные инструменты на базе web-технологий для создания моделей, интерфейса для проведения расчетов на гетерогенной вычислительной платформе HуbriLIT, визуализации результатов расчетов и предоставляет различным исследовательским группам среду для организации совместных исследований, обмена моделями и результатами расчетов.

Стадник Алексей Викторович

Алгоритмы для автоматизации обработки данных экспериментов радиобиологических исследований

В работе представлены результаты по разработке алгоритмического блока информационной системы, создаваемой в рамках совместного проекта ЛИТ им. М.Г. Мещерякова и ЛРБ, по автоматизации обработки экспериментальных данных радиобиологических исследований. Представлен набор программных средств для анализа поведенческих паттернов лабораторных животных и изучения патоморфологических изменений в центральной нервной системе после воздействия ионизирующего излучения и других факторов.
     Разработанные алгоритмы анализа данных построены на базе алгоритмов машинного и глубокого обучения и алгоритмов компьютерного зрения.
     Задачи анализа данных экспериментов включают в себя алгоритмы для анализа видеоматериалов и анализа изображений.
     В рамках анализа видеоматериалов разработаны алгоритмы автоматизированной разметки экспериментального поля установки, анализ характеристик поведения лабораторного животного в течение времени проведения эксперимента и формирование сводной информации по характеру поведения животных.
     Для анализа изображений разработаны алгоритмы, включающие в себя сегментацию и классификацию нейронов головного мозга лабораторных животных с учетом присутствующих на изображении шумов.
     Представленные алгоритмы реализованы как компоненты информационной системы, предоставляющей возможности для проведения анализа различным исследовательским группам в рамках совместных исследований.

 


Подключение к семинару:

Название: Общелабораторный семинар ЛИТ им. М.Г. Мещерякова

Местоhttps://jinr.webex.com/jinr/j.php?MTID=me8dc4b4ae6ca11ea3a5e73cab81b6374
Когда: 18 мая 2021 г. 15:00 – 17:00

Номер совещания (код доступа): 137 378 9112
Пароль совещания: Ugd2nwXAR29

Присоединиться по телефону
Только передача голоса по IP
 
Присоединение с помощью видеосистемы или приложения
Наберите 1373789112@jinr.webex.com
Также можно набрать 62.109.219.4 и ввести номер совещания.
 
Присоединиться с использованием Microsoft Lync или Microsoft Skype для бизнеса
Наберите 1373789112.jinr@lync.webex.com

The agenda of this meeting is empty